Identificazione Strutturale:
Determinazione univoca dell'entità molecolare e della corrispondenza di sequenza.
Registro metodologico di laboratorio
Protocollo di mappatura analitica (4 Fasi)
Ogni sessione di saggio e screening sui campioni peptidi segue un workflow standardizzato per garantire l'integrità dei dati riproducibili:
Caratterizzazione Strumentale:
Definizione del profilo fisico-chimico mediante metodologie analitiche ortogonali e standardizzate.
Tracciamento delle Fonti:
Mappatura dei lotti grezzi, dei laboratori di sintesi e dei database di riferimento.
Mappatura dei Limiti Metodologici:
Esplicitazione formale delle lacune informative o dei test non eseguiti (es. solventi residui o controioni non quantificati).
Metodo APEX: Validazione e isolamento dei dati
Il nostro team isola rigorosamente i dati analitici empirici (ottenuti in-house o da certificati di analisi validati) dai dati descrittivi presenti nella letteratura scientifica. I tracciati analitici e i documenti di tracciabilità vengono integrati nel profilo del peptide solo se superano i nostri controlli di qualità interni.
Framework di valutazione scientifica a 5 livelli
Applichiamo un sistema di classificazione gerarchica per pesare il livello di evidenza (Level of Evidence) di ogni informazione, distinguendo i dati empirici dalle ipotesi teoriche.
Identità molecolare (Verifica di sequenza)
Definizione univoca tramite ID standard (CAS, IUPAC). La massa monoisotopica e la sequenza amminoacidica vengono confermate mediante Spettrometria di Massa (MS) a d alta risoluzione o spettrometria tandem (MS/MS) per il sequenziamento de novo.
Purezza e profilo delle impurità (Dati empirici)
La purezza chimica viene determinata tramite Cromatografia Liquida a Fase Inversa (RP-HPLC) accoppiata a rilevazione UV o spettrometria di massa (LC-MS). Questo permette di mappare i prodotti di degradazione (es. peptidi troncati, deamidazioni o ossidazioni). In assenza di tracciati HPLC/MS, non vengono inserite stime o purezze teoriche.
Composizione amminoacidica e struttura (AAA & NMR)
L'esatta stechiometria dei blocchi costitutivi viene verificata tramite Analisi degli Amminoacidi (AAA) previa idrolisi acida totale. Laddove richiesto per lo studio dei meccanismi di folding o delle interazioni ligando-recettore, la conformazione 3D e gli stati conformazionali in soluzione vengono indagati tramite Spettroscopia NMR (1H, 13C, 15N).
Contesto biologico di ricerca
Catalogazione dei modelli sperimentali (saggi biochimici in vitro, colture cellulari o modelli in vivo) documentati in letteratura. Queste informazioni hanno finalità esclusivamente bibliografica per la ricerca di base e non costituiscono in alcun caso indicazioni cliniche, protocolli di somministrazione o dosaggi terapeutici.
Tracciabilità documentale e stabilità Associazione univoca del profilo al numero di lotto (Lot Number) e ai dati di stabilità (forzata o in tempo reale). Questo livello garantisce la piena tracciabilità della filiera di fornitura, isolando i dati analitici replicabili dalle variabili non documentate.
Gestione dei dati di ricerca
Separazione delle variabili chimiche e biologicheLe
fonti bibliografiche specificano i modelli e i target biologici studiati dalla comunità scientifica. Il nostro laboratorio mantiene una netta separazione tra le proprietà intrinseche del peptide puro (massa molecolare, spettro MS, purezza HPLC) e i dati fluttuanti legati al sistema biologico di saggio (es. variazioni di affinità dovute al buffer o al tipo di saggio enzimatico utilizzato).